长期正确饮用小青柑并没有危害，但几类人群不宜饮用，包括低龄儿童，长期饮用可能会影响发育；胃不好的人，长期饮用容易刺激胃部；肾不好的人，长期饮用会增加肾的负担。
长期饮用小青柑对身体没有害处，但注意有几类人群不宜喝小青柑。对于处于生长发育期的低龄儿童来说，不建议喝小青柑，可能会导致钙吸收不良，影响身体发育。并且，茶中的鞣酸容易与肠胃中的铁质结合，变成不溶解的物质，铁质的缺失可能会导致孩子贫血。
小青柑中含有大量的咖啡碱，对于有胃病的人群来说也不宜饮用，如果长期饮用小青柑，可能会使交感神经受到刺激，降低食欲，同时会使胃液分泌增加，造成空腹刺激，增加对胃部的负担。
小青柑中含有大量茶碱，也不宜肾功能不好的人饮用，茶中含有的茶碱具有很强的利尿效果，频繁小便容易加重肾脏的负担，尤其不能饮用浓茶，这可能诱发碱性物质的堆积，增加结石出现的风险。
