和普通公司注册的流程一样，营利性的去工商部门登记，民办非企业单位去民政局登记。
1、根据《个体工商户名称登记管理办法》、《企业名称登记管理规定》等相关法规、规章规定，除公司制企业外，包括个体工商户、个人独资企业、合伙企业名称可用“厂”、“店”、“馆”、“部”、“行”、“中心”等，也就是说可以使用“研究所”。
2、《个体工商户名称登记管理办法》规定个体工商户名称中行政区划为市辖区，您若申请个体工商户名称要表述为xx市樊城区xx研究所或xx区xx研究所，个人独资企业、合伙企业可以表述为xx市xx研究所。
3、研究所可以到工商部门申请营业执照登记，也可向民政部门申请民办非企业单位登记，区别是民办非企业单位从事非营利性社会服务活动，企业从事营利性社会服务活动。个体工商户登记可以到辖区工商所申请，也可到行政服务中心申请；个人独资企业、合伙企业登记需要到辖区工商所申请，建议就近办理。
